时为假想的19世纪末。将脆弱的为悲剧而叹息的心中的灵魂叫唤出来、用魔导式将这些灵魂集结制作出AKUMA（恶魔），AKUMA成为不断重复着杀戮的杀人武器。因为诞生着更多的恐惧和悲剧而不断进化。制造AKUMA的，是企图将世界引向终结的千年伯爵率领的“诺亚一族”。而能将AKUMA破坏的唯一力量，来自于叫做“黑色教团”的组织。很久以前开始双方持续的战斗中、隐藏在背后的真相是？

二战之后，随着超级霸权间的核竞争，灭世之战一触即发。活在愚民统治中的国民还不知道，一场真正的危机即将席卷全球。图灵八年，也就是灭世之前的西元1962年。古巴导弹危机的意外，引爆了所有核弹。这场毁灭世界

《魔笛MAGI 辛巴达的冒险》作为《魔笛MAGI》的前章，主要讲述的是围绕30年前少年时期的七海霸主辛巴达展开的全新魔导冒险谭，而各位也能从本作中看到《魔笛MAGI》中一些角色年轻时候的样子。

故事中的世界是以中世纪欧洲为基本架构，除了人类以外还有龙、精灵以及哥布林的存在，是典型的托尔金系统中的奇幻世界。神与魔不断地纷争，神为了保卫世界而战；魔为了争取长杖毁灭世界而战。赤眼魔王和赤龙神为了各自的目的而战。赤龙神将赤眼魔王击败，并将它分为七部份。为了防范魔族的行动，他化为四个分身固守着四方。

　　在某个村落的旅馆餐厅里，莉娜正准备大口吃她的午餐。突然一阵爆炸声袭击了这个餐厅，并搞砸了她享受这午餐的一点点幸福。突然，旅馆餐厅的屋顶传来可怕的狂笑声，一身坏魔导士装扮的娜卡，从火焰中出现。娜卡精神抖擞的出场，却招来全村的愤怒。被村人包围的娜卡和认识她的莉娜，陷入了必须找出失踪的村民来代替所有赔偿的窘境。可是两人所前往的遗迹里，却有个最恐怖的吸血鬼在等着他们！

世界受“魔甲虫”威胁，大地遭其占据，人类只能住在天空中的浮游都市里。之后，以魔力对抗“魔甲虫”的魔法师——空战魔导士诞生了。就读空战魔导士培育机构——学园浮游都市“密斯特岗”的彼方·英司，是拥有“黑之剑圣”称号的S128特务小队的王牌。然而，如今他却被视为“特务小队的叛徒”而受到众人的轻蔑与厌恶……某天，彼方被任命为连战皆败的E601小队教官。这支小队收容了三名个性特异的少女——？由叛徒与问题学生少女们展开的进击，现在启动！

有些复古风味的街道·四皇町。住在那里的立华律香，是位就读于四皇学园高中二年级的少女。她期待着去英国留学的哥哥·林多偶尔的联络，和母亲一起过着平稳的日常生活。某天，她被众多学生所憧憬的学生会长·钩贯雷姆叫了出来，在学生会成员集合的“第三图书馆”展开了一场不可思议的邂逅。恶魔、吸血鬼、驱魔师。围绕着“禁断的魔导书”，各种思绪开始转动——是人，还是恶魔？这是被魔所魅惑、被魔所爱的，一位少女的物语。

为了寻找能够代替在上一次战斗中失去了的“ 光之剑”的武器，莉娜与高里再一次踏上了旅途。在途中遇见了为了作掉海贼而造访露维纳刚鲁多王国的阿美利亚与吉路刚帝士，虽然为老朋友间的再会而感到喜悦，但是、在他们面前出现了的露维纳刚鲁多王国的监察者——特务搜查官，一个被称为瓦依扎的男人。他的想法与行动让莉娜感到愕然……

第二部(NEXT)讲述了人类与魔族的关系，可是说已经开始进入《秀逗魔导士》的中心主题!在这一部里所谓的魔族才真正的出现了!首先是魔族的神秘官杰洛士，他的出现可以说是引导出下面一系列故事的关键人物，也是带领主角们与魔族的关系越来越深的人物所在!他清楚的了解主角们的个性，并利用他们个性来完成他的任务!他知道莉娜是个天生对于研究高强魔法非常执着的人，于是他透露出‘克雷圣经’的抄写本的下落，而一开始并不知道杰洛士身份的主角们便随着他的情报到处旅行，到处寻找这本‘克雷圣经’的抄写本

　　史东那城市到处都有因魔力而动的魔偶，在这里的两位伯爵海建与葛拉尼欧正在争夺城镇的主导权。於是两人达成协议要以魔偶对决来决定一切。生在魔偶工匠家族的不幸少女莱雅，因家中父兄两人的不合而伤透脑筋。其父兄两人也莫名地卷入这场城主之争，并且竟然做出莉娜和娜卡的魔偶！究竟史东那城市真正的未来与和平是否真的会到来呢？　　莉娜在结尾被抢走钱币之後，使用「覇王雷撃阵(ダイナスト?ブラス)」取回钱币。